在医学，柠檬酸钠的用途也很广泛。利用柠檬酸根与钙离子能形成可溶性络合物的特性，可用作剂和输血剂，保存和加工血制品。柠檬酸钠作为防腐剂，用于保存糖浆等。柠檬酸钠注射时和钾盐一样，用于矫正血液、体液及尿液的酸度，作为化痰剂等。柠檬酸钠与别的试剂配伍可用于提取、纯化动物糖核酸。
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广泛用于食品、饮料、香料行业作为酸味剂、调味剂及防腐剂、保鲜剂、缓冲剂、螯合剂。在化工行业、化妆品行业及洗涤行业中作、增塑剂、洗涤剂。医行业中作抗凝剂。化工、皮革、印刷、电镀及原子能等工业。
柠檬酸钠具有水溶性好、对水中的Ca2 、Mg2 等金属离子具有优良的螯合能力、能发生生物降解、分散能力及抗再沉积能力强等特点，因此正逐渐成为三聚磷酸钠的替代品，柠檬酸钠报价，被用来生产无磷洗衣粉，尤其是无磷液体洗涤剂。洗涤剂中加入一定量的柠檬酸钠，能明显增加洗涤剂的去污能力。
柠檬酸钠在食品、饮料工业中用作酸度调节剂、风味剂、稳定剂。现行标准GB1886.25—2016代替GB6782—2009《食品添加剂 柠檬酸钠》。本标准与GB6782—2009相比，主要变化如下：标准名称修改为“食品安全 食品添加剂 柠檬酸钠”。
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